HLADB-2.23.0-Oct 2008 HLA-A Genomic Nucleotide Sequence Alignments Sequences Aligned: 10 Oct 2008 Steven G. E. Marsh, Anthony Nolan Research Institute. 5' UTR Promoter Sequence kB2 Element gDNA -300 -217 -207 cDNA -300 -217 -207 | | | A*01010101 CAGGAGCAGA GGGGTCAGGG CGAAGTCCCA GGGCCCCAGG CGTGGCTCTC AGGGTCTCAG GCCCCGAAGG CGGTGTATGG ATTGGGGAGT CCCAGCCTTG A*01010102N ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** *********- ---------- ---------- A*0104N ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ****------ ---------- A*0109 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** A*0111N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0114 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** A*0116N ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** A*0120 ********** ********** ********** 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-------T-- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*0253N | ---------- ---------- -------G-- ---------- -------T-- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*0257 | ---------- ---------- -------G-- ---------- -------T-- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*0260 | ---------- ---------- -------G-- ---------- -------T-- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*0265 | ---------- ---------- -------G-- ---------- -------T-- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*0268 | ---------- ---------- -------G-- ---------- -------T-- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*0277 | ---------- ---------- -------G-- ---------- -------T-- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*0281 | ---------- ---------- -------G-- ---------- -------T-- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*0289 | ---------- ---------- -------G-- ---------- -------T-- ---------- 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---------- --- | ------- ---------- ---------- A*2307N | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- -A- | ------- ---------- --------G- A*2309 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- -A- | ------- ---------- --------G- A*24020101 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- -A- | ------- ---------- --------G- A*24020102L | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- -A- | ------- ---------- --------G- A*240203 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- -A- | ------- ---------- --------G- A*240210 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- -A- | ------- ---------- --------G- A*2409N | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- -A- | ------- ---------- --------G- A*2411N | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- -A- | ------- ---------- --------G- A*2461 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- -A- | ------- ---------- --------G- A*2486N | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- -A- | ------- ---------- --------G- A*260101 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*2611N | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*2615 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*29010101 | ---------- ---------- ---------- ---------- T--------- ---------- ---------- --- | ------- --------T- .--------- A*29010102N | ---------- ---------- ---------- ---------- T--------- ---------- ---------- --- | ------- --------T- .--------- A*290201 | ---------- ---------- ---------- ---------- T--------- ---------- ---------- --- | ------- --------T- .--------- A*300201 | ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*3104 | ---------- ---------- ---------- ---------- T--------- ---------- ---------- --- | ------- --------T- .--------- A*3114N | ---------- ---------- ---------- ---------- T--------- ---------- ---------- --- | ------- --------T- .--------- A*320101 | ---------- ---------- ---------- ---------- T--------- ---------- ---------- --- | ------- --------T- .--------- A*3307 | ---------- ---------- ---------- ---------- T--------- ---------- ---------- --- | ------- --------T- .--------- A*680101 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*68020101 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*68020102 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*68020103 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*680202 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*6808 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*6817 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*6818N | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- A*6822 | ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- --------G- gDNA 101 cDNA | A*01010101 CCTCTGCGGG GAGAAGCAAG GGGCCCTCCT GGCGGGGGCG CAGGACCGGG GGAGCCGCGC CGGGAGGAGG GTCGGGCAGG TCTCAGCCAC TGCTCGCCCC A*01010102N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 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-------C-- -A-------- ---------- -------G-- ---------- -C----T--- A*0268 ------T--- ---------C ------G--- ---------- -------C-- -A-------- ---------- -------G-- ---------- -C----T--- A*0277 ------T--- ---------C ------G--- ---------- -------C-- -A-------- ---------- -------G-- ---------- -C----T--- A*0281 ------T--- ---------C ------G--- ---------- -------C-- -A-------- ---------- -------G-- ---------- -C----T--- A*0289 ------T--- ---------C ------G--- ---------- -------C-- -A-------- ---------- -------G-- ---------- -C----T--- A*03010101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----C---- ---------- ---------- ---------- A*03010102N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----C---- ---------- ---------- ---------- A*03010103 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----C---- ---------- ---------- ---------- A*0311N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----C---- ---------- 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------G--- ---------- --A----C-- -A-------- ---------- -------G-- ---------- -C----T--- A*240210 ---------- ---------- ------G--- ---------- --A----C-- -A-------- ---------- -------G-- ---------- -C----T--- A*2409N ---------- ---------- ------G--- ---------- --A----C-- -A-------- ---------- -------G-- ---------- -C----T--- A*2411N ---------- ---------- ------G--- ---------- --A----C-- -A-------- ---------- -------G-- ---------- -C----T--- A*2461 ---------- ---------- ------G--- ---------- --A----C-- -A-------- ---------- -------G-- ---------- -C----T--- A*2486N ---------- ---------- ------G--- ---------- --A----C-- -A-------- ---------- -------G-- ---------- -C----T--- A*260101 ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- A*2611N ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- A*2615 ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- A*29010101 ---------- ---------- ------G--C -------A-- -------C-- -T-------- ---------- ------TG-- ---------- -C-------- A*29010102N ---------- ---------- ------G--C -------A-- -------C-- -T-------- ---------- ------TG-- -----C---- -C-------- A*290201 ---------- ---------- ------G--C -------A-- -------C-- -T-------- ---------- ------TG-- ---------- -C-------- A*300201 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----T---- ---------- ---------- A*3104 ---------- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -T-------- ---------- -------G-A ---------- -C-------- A*3114N ---------- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -T-------- ---------- -------G-A ---------- -C-------- A*320101 ---------- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -T-------- ---------- -------G-- ---------- -C-------- A*3307 ---------- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -T-------- ---------- -------G-A ---------- -C-------- A*680101 ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- A*68020101 ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- A*68020102 ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- A*68020103 ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- A*680202 ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- A*6808 ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- A*6817 ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- A*6818N ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- A*6822 ------T--- ---------- ------G--C ---------- -------C-- -A-------- -T-------- -------G-- ---------- -C-------- Intron 1 | Exon 2 gDNA 203 | 204 cDNA | 75 | | | A*01010101 CAG | GCTCCCA CTCCATGAGG TATTTCTTCA CATCCGTGTC CCGGCCCGGC CGCGGGGAGC CCCGCTTCAT CGCCGTGGGC TACGTGGACG ACACGCAGTT A*01010102N --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0104N --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0109 --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0111N --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0114 --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0116N --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0120 --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- A-T--A---- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*02010101 --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*02010102L --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*02010103 --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0205 --- | ----T-- ---------- -------A-- -C-------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0232N --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0243N --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0251 --- | ----T-- ---------- -------A-- -C-------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0253N --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0257 --- | ----T-- ---------- -------A-- -C-------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0260 --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0265 --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0268 --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0277 --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0281 --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*0289 --- | ----T-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*03010101 --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*03010102N --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*03010103 --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0311N --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0321N --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0336N --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*1105 --- | ------- ---------- -------A-- -C-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*1125 --- | ------- ---------- -------A-- -C-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2307N --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2309 --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*24020101 --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*24020102L --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*240203 --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*240210 --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2409N --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2411N --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2461 --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2486N --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*260101 --- | ------- ---------- -------A-- -C-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2611N --- | ------- ---------- -------A-- -C-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2615 --- | ------- ---------- -------A-- -C-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*29010101 --- | ------- ---------- ------AC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*29010102N --- | ------- ---------- ------AC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*290201 --- | ------- ---------- ------AC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*300201 --- | ------- ---------- -------C-- ---------- ---------- A-T--A---- ---------- ---A------ ---------- ---------- A*3104 --- | ------- ---------- ------AC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*3114N --- | ------- ---------- ------AC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*320101 --- | ------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*3307 --- | ------- ---------- ------AC-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*680101 --- | ------- ---------- -------A-- -C-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*68020101 --- | ------- ---------- -------A-- -C---A---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*68020102 --- | ------- ---------- -------A-- -C---A---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*68020103 --- | ------- ---------- -------A-- -C---A---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*680202 --- | ------- ---------- -------A-- -C---A---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*6808 --- | ------- ---------- -------A-- -C-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*6817 --- | ------- ---------- -------A-- -T-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*6818N --- | ------- ---------- -------A-- -C---A---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*6822 --- | ------- ---------- -------A-- -C-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Insert gDNA 301 343 344 cDNA 172 213 214 | | | A*01010101 CGTGCGGTTC GACAGCGACG CCGCGAGCCA GAAGATGGAG CCG....................CGGGCGC CGTGGATAGA GCAGGAGGGG CCGGAGTATT GGGACCAGGA GACACGGAAT A*01010102N ---------- ---------- ---------- ---------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0104N ---------- ---------- ---------- ---------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0109 A--------- ---------- ---------- ---------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0111N ---------- ---------- ---------- ---------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0114 ---------- ---------- ---------- ---------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0116N ---------- ---------- ---------- ---------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0120 ---------- ---------- ---------- ---------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*02010101 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*02010102L ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*02010103 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0205 ---------- ---------- ---------G --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0232N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0243N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0251 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0253N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0257 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0260 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0265 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0268 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0277 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0281 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*0289 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------T ---------- -----GG--- ---------A A*03010101 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*03010102N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*03010103 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0311N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0321N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0336N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---....... A*1105 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*1125 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2307N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- -----G---- ----G----A A*2309 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*24020101 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- -----G---- ----G----A A*24020102L ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- -----G---- ----G----A A*240203 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- -----G---- ----G----A A*240210 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- -----G---- ----G----A A*2409N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- -----G---- ----G----A A*2411N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- -----G---- ----G----A A*2461 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- -----G---- ----G----A A*2486N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- -----G---- ----G----A A*260101 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*2611N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*2615 ---------G ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*29010101 ---------T ---------- ---------- --G------- ---....................-----A- ---------- ---------- ---------- ------T-C- ---------- A*29010102N ---------T ---------- ---------- --G------- ---....................-----A- ---------- ---------- ---------- ------T-C- ---------- A*290201 ---------T ---------- ---------- --G------- ---....................-----A- ---------- ---------- ---------- ------T-C- ---------- A*300201 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- -------A-- --T------- ---------- ---------- A*3104 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- -------A-- --T------- ---------- ---------- A*3114N ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- -------A-- --T------- ---------- ---------- A*320101 ---------T ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*3307 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*680101 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*68020101 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*68020102 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*68020103 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*680202 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*6808 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*6817 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*6818N ---------- ---------- ---------- --G------- ---CGAGCCAGAGGATGGAGCCG------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- A*6822 ---------- ---------- ---------- --G------- ---....................------- ---------- ---------- ---------- ------G-A- C--------- Exon 2 | Intron 2 gDNA 401 473 | 474 cDNA 272 343 | | | | | A*01010101 ATGAAGGCCC ACTCACAGAC TGACCGAGCG AACCTGGGGA CCCTGCGCGG CTACTACAAC CAGAGCGAGG ACG | GTGAGTG ACCCCGGCCC GGGGCGCAGG A*01010102N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ----... .--------- ---------- A*0104N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*0109 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*0111N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*0114 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*0116N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*0120 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*02010101 G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*02010102L G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*02010103 G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0205 G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0232N G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0243N G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0251 G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0253N G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---G------ ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0257 G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0260 G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0265 G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0268 G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0277 G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0281 G--------- ---------- --------A- -G----C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*0289 G--------- ---------- -C------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*03010101 G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------G ---------- A*03010102N G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------G ---------- A*03010103 G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------G -T-------- A*0311N G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------G ---------- A*0321N G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------G ---------- A*0336N .......... .......... --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------G ---------- A*1105 G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*1125 G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*2307N G--------- ---------- --------A- ------C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*2309 ---------- ---------- --------A- ------C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*24020101 G--------- ---------- --------A- ------C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*24020102L G--------- ---------- --------A- ------C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*240203 G--------- ---------- --------A- ------C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*240210 G--------- ---------- --------A- ------C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*2409N G--------- ---------- --------A- ------C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*2411N G--------- ---------- --------A- ------C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*2461 G--------- ---------- --------A- --A---C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*2486N G--------- ---------- --------A- ------C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*260101 G--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*2611N G--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*2615 G--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --- | ------- ---------- ---------- A*29010101 G--------- -G-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*29010102N G--------- -G-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*290201 G--------- -G-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*300201 G--------- ---------- --------A- ---------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ------C--G ---------- A*3104 G--------- ---------T --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- -----A---- ---------- A*3114N G--------- ---------T --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- -----A---- ---------- A*320101 G--------- ---------- --------A- -G----C--- T-GC--T-C- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*3307 G--------- ---------T --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- -----A---- ---------- A*680101 G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*68020101 G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*68020102 G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*68020103 G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*680202 G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*6808 G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*6817 G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*6818N G--------- -G-------- --------T- G--------- ---------- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- A*6822 G--------- -G-------- --------T- G--------- ------A--- ---------- ---------- C-- | ------- ---------- ---------- gDNA 501 cDNA | A*01010101 TCACGACCCC TCATCCCCCA CGGACGGGCC AGGTCGCCCA CAGTCTCCGG GTCCGAGATC CACCCCGAAG CCGCGGGACT CCGAGACCCT TGTCCCGGGA A*01010102N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0104N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0109 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------G-- ---------- ---------- A*0111N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0114 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0116N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0120 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*02010101 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*02010102L --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*02010103 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*0205 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*0232N --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*0243N --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*0251 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*0253N --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*0257 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*0260 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*0265 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*0268 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*0277 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*0281 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*0289 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*03010101 ---G------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*03010102N ---G------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*03010103 ---G------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*0311N ---G------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*0321N ---G------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*0336N ---G------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*1105 ---------- ---------- ---------- ----G----- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*1125 ---------- ---------- ---------- ----G----- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*2307N ---------- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*2309 ---------- ----T----- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*24020101 ---------- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*24020102L ---------- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*240203 ---------- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*240210 ---------- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*2409N ---------- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*2411N ---------- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*2461 ---------- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*2486N ---------- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*260101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*2611N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*2615 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*29010101 --------T- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*29010102N --------T- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*290201 --------T- ---------- ---------- G--------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*300201 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --A------- A*3104 --------T- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*3114N --------T- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*320101 --------T- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*3307 --------T- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- --C------- A*680101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*68020101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*68020102 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*68020103 ........-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*680202 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*6808 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*6817 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*6818N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- A*6822 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -G-------- ---------C ---------- --C------- Ins gDNA 601 618 619 cDNA | | | A*01010101 GAGGCCCAGG CGCCTTTA.CC CGGTTTCATT TTCAGTTTAG GCCAAAAATC CCCCCGGGTT GGTCGGGGCG GGGCGGGGCT CGGGGGACTG GGCTGACCGC A*01010102N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0104N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0109 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0111N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0114 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0116N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0120 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*02010101 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*02010102L ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*02010103 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*0205 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*0232N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*0243N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*0251 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*0253N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*0257 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------- A*0260 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*0265 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C --A------- ---------- ---------T A*0268 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*0277 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*0281 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*0289 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- -----A---- ---------- ---------- --------C- ---------- A*03010101 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------- A*03010102N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------- A*03010103 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------- A*0311N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------- A*0321N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------- A*0336N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------- ---------- A*1105 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ----A----- T--------- ---------- A*1125 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ----A----- T--------- ---------- A*2307N ---------- ------A-.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------- A*2309 ---------- ------A-.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------- A*24020101 ---------- ------A-.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------- A*24020102L ---------- ------A-.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------- A*240203 ---------- ------A-.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------- A*240210 ---------- ------A-.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------- A*2409N ---------- ------A-.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------- A*2411N ---------- ------A-.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------- A*2461 ---------- ------A-.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------- A*2486N ---------- ------A-.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C ---------- ---------- ---------- A*260101 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- A*2611N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- A*2615 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- A*29010101 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C --A------- ---------- ---------T A*29010102N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C --A------- ---------- ---------T A*290201 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C --A------- ---------- ---------T A*300201 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------T ---------- ---------T ---------- ---------- ---------- A*3104 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C --A------- ---------- ---------T A*3114N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C --A------- ---------- ---------T A*320101 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C --A------- ---------- ---------T A*3307 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------C --A------- ---------- ---------T A*680101 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- A*68020101 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- A*68020102 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- A*68020103 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- A*680202 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- A*6808 ---------- --------A-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- A*6817 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- A*6818N ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- A*6822 ---------- --------.-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------C- --------T- Intron 2 | Exon 3 gDNA 701 714 | 715 cDNA | 344 | | | | A*01010101 GGGGTCGGGG CCAG | GTTCTC ACACCATCCA GATAATGTAT GGCTGCGACG TGGGGCCGGA CGGGCGCTTC CTCCGCGGGT ACCGGCAGGA CGCCTACGAC A*01010102N ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0104N ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0109 ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0111N ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0114 ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0116N ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0120 ---------- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*02010101 ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*02010102L ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*02010103 ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*0205 ------C--- ---- | ------ -----C---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- --G------- ---AC---T- ---------- A*0232N ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*0243N ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*0251 ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*0253N ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*0257 ---------- ---- | ------ -----C---- ---G------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*0260 ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---TT ---------- A*0265 ---------- ---- | ------ ---------- ---G------ ---------- ---------- -------C-- ---------- ---A------ ---------- A*0268 ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*0277 ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*0281 ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*0289 ------C--- ---- | ------ -----G---- --GG------ ---------- -----T---- -T-------- ---------- ---AC---T- ---------- A*03010101 ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---------- A*03010102N ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---------- A*03010103 ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0311N ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------- ------A--- A*0321N ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0336N ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---------- A*1105 ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*1125 ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2307N ---------- ---- | ------ -----C---- ---G----T- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*2309 ---------- ---- | ------ -----C---- ---G----T- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*24020101 ---------- ---- | ------ -----C---- ---G----T- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*24020102L -------A-- ---- | ------ -----C---- ---G----T- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*240203 ---------- ---- | ------ -----C---- ---G----T- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*240210 ---------- ---- | ------ -----C---- ---G----T- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*2409N ---------- ---- | ------ -----C---- ---G----T- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*2411N ---------- ---- | ------ -----C---- ---G----T- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*2461 ---------- ---- | ------ -----C---- ---G----T- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*2486N ---------- ---- | ------ -----C---- ---G----T- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*260101 ------C--- ---- | ------ ---------- --GG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---T------ A*2611N ------C--- ---- | ------ ---------- --GG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---T------ A*2615 ------C--- ---- | ------ ---------- --GG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---A------ ---T------ A*29010101 ---------- ---- | ------ ---------- ---G------ ------C--- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---------- A*29010102N ---------- ---- | ------ ---------- ---G------ ------C--- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---------- A*290201 ---------- ---- | ------ ---------- ---G------ ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---------- A*300201 ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- -----T---- ---------- ---------- -TGAA---C- ---------- A*3104 ---------- ---- | ------ ---------- ---------- ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---T------ A*3114N ---------- ---- | ------ ---------- ---G------ ---------- -----T---- ---------- ---------- ---A------ ---------- A*320101 ---------- ---- | ------ ---------- ---G------ ---------- ---------- -------C-- ---------- ---A------ ---------- A*3307 ---------- ---- | ------ ---------- ---G------ ---------- -----T---- ---------- ---------- ---A------ ---------- A*680101 ------C--- ---- | ------ ---------- ---G------ ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---------- A*68020101 ------C--- ---- | ------ ---------- --GG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*68020102 ------C--- ---- | ------ ---------- --GG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*68020103 ------C--- ---- | ------ ---------- --GG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*680202 ------C--- ---- | ------ ---------- --GG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*6808 ------C--- ---- | ------ ---------- ---G------ ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---------- A*6817 ------C--- ---- | ------ ---------- ---G------ ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------T ---------- A*6818N ------C--- ---- | ------ ---------- --GG------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---AC---T- ---------- A*6822 ------C--- ---- | ------ ---------- ---G------ ---------- -----T---- ---------- ---------- ---------- ---------- Ins gDNA 801 887 888 cDNA 430 516 517 | | | A*01010101 GGCAAGGATT ACATCGCCCT GAACGAGGAC CTGCGCTCTT GGACCGCGGC GGACATGGCA GCTCAGATCA CCAAGCGCAA GTGGGAG..GCG GTCCATGCGG A*01010102N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------..--- ---------- A*0104N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------..--- ---------- A*0109 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------..--- ---------- A*0111N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------..--- ---------- A*0114 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------..--- ---------- A*0116N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------..--- ---------- A*0120 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------..--- ---------- A*02010101 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*02010102L ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*02010103 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*0205 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*0232N ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- ---T---C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*0243N ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*0251 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C--G--T-- A*0253N ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*0257 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*0260 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*0265 ---------- --------T- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..--- -C--G--T-- A*0268 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*0277 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*0281 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*0289 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*03010101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----A-- A*03010102N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----A-- A*03010103 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----A-- A*0311N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----A-- A*0321N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----A-- A*0336N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----A-- A*1105 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --G------- -------..--- -C-------- A*1125 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------..--- -C-----A-- A*2307N ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..--- -C--G--T-- A*2309 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..--- -C--G--T-- A*24020101 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----T-- A*24020102L ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----T-- A*240203 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----T-- A*240210 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----T-- A*2409N ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----T-- A*2411N ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----T-- A*2461 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----T-- A*2486N ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------G ---------- ---------- -------..--- -C-----T-- A*260101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..A-- -C-----A-- A*2611N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------ACT-C -C-----A-- A*2615 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..A-- -C-----A-- A*29010101 ---------- --------T- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..--- -C--G--T-- A*29010102N ---------- --------T- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..--- -C--G--T-- A*290201 ---------- --------T- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..--- -C--G--T-- A*300201 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..--- -C--G-CG-- A*3104 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..--- -C--G--T-- A*3114N ---------- --------T- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..--- -C--G--T-- A*320101 ---------- --------T- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..--- -C--G--T-- A*3307 ---------- --------T- ---------- ---------- ---------- ---------G ---------- --C------- -------..--- -C--G--T-- A*680101 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*68020101 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*68020102 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*68020103 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*680202 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*6808 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*6817 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*6818N ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- A*6822 ---------- ---------- ---A------ ---------- ---------- ---------- -------C-- ------A--- -------..--- -C-----T-- Ins Exon 3 | Intron 3 gDNA 901 984 985 990 | 991 cDNA 530 613 614 619 | | | | | A*01010101 C.GGAGCAGCG GAGAGTCTAC CTGGAGGGCC GGTGCGTGGA CGGGCTCCGC AGATACCTGG AGAACGGGAA GGAGACGCTG CAGC.................GCACGG | GTACCAGGGG A*01010102N -.--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0104N -.--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0109 -.--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0111N -.--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------T-- ---------- ----.................------ | ---------- A*0114 -.--------- ---------- ---------A C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0116N -G--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0120 -.--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*02010101 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*02010102L -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*02010103 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0205 -.-------T- -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0232N -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0243N -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0251 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0253N -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0257 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0260 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0265 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0268 -.-------TT --A--C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0277 -.-------TT -----C---- ---------A C--------T GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0281 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0289 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*03010101 -.-------TT -----C---- -----T---A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*03010102N -.-------TT -----C---- -----T---A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*03010103 -.-------TT -----C---- -----T---A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0311N -.-------TT -----C---- -----T---A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0321N -.-------TT -----C---- -----T---A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*0336N -.-------TT -----C---- -----T---A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*1105 -.--------A -----C---- ---------- ---------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*1125 -.-------TT -----C---- ---------- ---------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*2307N -.-------TT -----C---- ---------A C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*2309 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*24020101 -.--------A -----C---- ---------A C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*24020102L -.--------A -----C---- ---------A C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*240203 -.--------A -----C---- ---------A C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*240210 -.--------A -----C---- ---------A C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*2409N -.--------A -----C---- ---------A C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*2411N -.--------A -----C---- ---------A C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*2461 -.--------A -----C---- ---------A C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*2486N -.--------A -----C---- ---------A C--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----GAAGGAGACGCTGCAGC------ | ---------- A*260101 -.-------T- -----C---- ---------- ---------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*2611N -.-------T- -----C---- ---------- ---------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*2615 -.-------T- -----C---- ---------- ---------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*29010101 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | -----G---- A*29010102N -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | -----G---- A*290201 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | -----G---- A*300201 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*3104 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*3114N -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*320101 -.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*3307 A.-------TT -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---C------ ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*680101 -.-------T- -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*68020101 -.-------T- -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*68020102 -.-------T- -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*68020103 -.-------T- -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*680202 -.-------T- -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................----T- | ---------- A*6808 -.--------T -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*6817 -.-------T- -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*6818N -.-------T- -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- A*6822 -.-------T- -----C---- ---------A C--------- GT-------- ---------- ---------- ---------- ----.................------ | ---------- gDNA 1001 cDNA | A*01010101 CCACGGGGCG CCTCCCTGAT CGCCTATAGA TCTCCCGGGC TGGCCTCCCA CAAGGAGGGG AGACAATTGG GACCAACACT AGAATATCAC CCTCCCTCTG A*01010102N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0104N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0109 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0111N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0114 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0116N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0120 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*02010101 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*02010102L ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*02010103 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0205 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0232N ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0243N ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0251 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0253N ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0257 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0260 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0265 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0268 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0277 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0281 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*0289 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*03010101 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*03010102N ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*03010103 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0311N ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0321N ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0336N ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*1105 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*1125 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2307N ---------- ---A------ -----G---G ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*2309 ---------- ---A------ -----G---G ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*24020101 ---------- ---A------ -----G---G ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*24020102L ---------- ---A------ -----G---G ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*240203 ---------- ---A------ -----G---G ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*240210 ---------- ---A------ -----G---G ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*2409N ---------- ---A------ -----G---G ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*2411N ---------- ---A------ -----G---G ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*2461 ---------- ---A------ -----G---G ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*2486N ---------- ---A------ -----G---G ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*260101 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*2611N ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*2615 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*29010101 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*29010102N ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*290201 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*300201 ---------- ---T------ -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*3104 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*3114N ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*320101 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*3307 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*680101 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*68020101 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*68020102 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*68020103 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*680202 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*6808 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*6817 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*6818N ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- A*6822 ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------G- ---------- gDNA 1101 cDNA | A*01010101 GTCCTGAGGG AGAGGAATCC TCCTGGGTTT CCAGATCCTG TACCAGAGAG TGACTCTGAG GTTCCGCCCT GCTCTCTGAC ACAATTAAGG GATAAAATCT A*01010102N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0104N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0109 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0111N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0114 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0116N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0120 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*02010101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*02010102L ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*02010103 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0205 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0232N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0243N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0251 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0253N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0257 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0260 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0265 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0268 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0277 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0281 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0289 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*03010101 ---------- ---------- ---------. ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*03010102N ---------- ---------- ---------. ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*03010103 ---------- ---------- ---------. ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0311N ---------- ---------- ---------. ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0321N ---------- ---------- ---------. ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0336N ---------- ---------- ---------. ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*1105 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*1125 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2307N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2309 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*24020101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*24020102L ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*240203 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*240210 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2409N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2411N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2461 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2486N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*260101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2611N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*2615 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*29010101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*29010102N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*290201 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*300201 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- T--------- ---------- A*3104 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------G--- -----G---- ---------- ---------- A*3114N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- A*320101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*3307 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----G---- ---------- ---------- A*680101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*68020101 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*68020102 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*68020103 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*680202 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*6808 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*6817 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*6818N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- A*6822 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- Ins gDNA 1201 1255 1256 cDNA | | | A*01010101 CTGAAGGAGT GACGGGAAGA CGATCCCTCG AATACTGATG AGTGGTTCCC TTTGA....CACCG GCAGCAGCCT TGGGCCCGTG ACTTTTCCTC TCAGGCCTTG A*01010102N ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----....----- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0104N ---------- ---------- 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---------- ---------- -----CACA---A- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0205 --------A- ---------- ---------- ---------- ---------- -----CACA---A- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0232N --------A- ---------- ---------- ---------- ---------- -----CACA---A- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0243N --------A- ---C------ ---------- ---------- ---------- -----CACA---A- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0251 --------A- ---------- ---------- ---------- ---------- -----CACA---A- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0253N --------A- ---------- ---------- ---------- ---------- -----CACA---A- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0257 --------A- ---------- ---------- ---------- ---------- -----CACA---A- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0260 --------A- ---------- ---------- ---------- ---------- -----CACA---A- ---------- ---------- ---------- ---------- A*0265 --------A- ---------- ---------- ---------- ---------- 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----A----- ---------- ---------- A*240203 ----C---A- -----A---- ---------- ---------- -C-------- -----....----- ---------- ----A----- ---------- ---------- A*240210 ----C---A- -----A---- ---------- ---------- -C-------- -----....----- ---------- ----A--